Matsuineko
@matsuneko25
変異株について、倉持先生の病院に持ち込まれた検体を遺伝研の川上先生がゲノム解析 国内独自と思われる変異株が見つかったとのこと 一連のスレッド、重要な情報が凝縮されてるのでぜひどうぞ twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-12 08:19:45
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 倉持先生とは昨年来、共同研究の体制を構築してきました。 新しい結果が出たので、これまで応援して下さった方たちにシェアします。論文形式で記載しますね。 [方法]検体からRNAを抽出し、S蛋白質遺伝子特異的プライマーによるRT-PCRを行い、得られた約500bpのDNAの塩基配列を決定した。↓
2021-03-11 22:17:14
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 倉持先生とは昨年来、共同研究の体制を構築してきました。 新しい結果が出たので、これまで応援して下さった方たちにシェアします。論文形式で記載しますね。 [方法]検体からRNAを抽出し、S蛋白質遺伝子特異的プライマーによるRT-PCRを行い、得られた約500bpのDNAの塩基配列を決定した。↓
2021-03-11 22:17:14
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV [結果]6検体を解析した。1月に採取された5検体のS遺伝子は従来型であったが、最近採取された1検体はE484K変異をもっていた。南アフリカ株はE484K以外にN501Y、K417N変異をもつことが知られているが、この検体由来のS遺伝子はN501Y、K417N変異をもっていなかった(下図参照)。↓ pic.twitter.com/ZQmCdMrIYM
2021-03-11 22:32:17
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Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV 下の図は、私たちがDNAの塩基配列を解析する際によく使う波形の図です。矢印が示している、1塩基の変異(GからAへの変異)が、遺伝暗号を変化させ、アミノ酸のE(グルタミン酸)からK(リジン)への変異を引き起こします。↓ pic.twitter.com/p8oeZLh7ei
2021-03-11 22:47:26
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Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV [考察]今回インターパーク倉持呼吸器内科で見つかったE484K変異株は、英国株(B.1.1.7)、南アフリカ株(B.1.351)、ブラジル株(P.1)とは異なる。慶應大の報告(news.yahoo.co.jp/articles/e2f8c…)、あるいは厚労省の報告(jp.reuters.com/article/health…)と同一か？は、全ゲノム解析により明らかになるであろう(進行中)。↓
2021-03-11 23:00:37
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV この変異株が、どのくらい拡がっているか？も、さらなる追跡、解析が必要。日本国内で誕生したものか？については今後の解析で明らかにできると考えます。 [謝辞]井ノ上先生、光永先生、白木博士（遺伝研） ここまで// 質問がありましたら、可能な範囲で答えます。
2021-03-11 23:06:16
倉持仁
@kuramochijin
@koichi_kawakami ありがとうございます。 手弁当になりますが、国にとって必要なことですので、引き続きご尽力よろしくお願い申し上げます！
2021-03-11 23:19:49
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@UCiS7MEgWj6L7cV 自治体や保健所等、関係者へのご対応をよろしくお願いいたします。
2021-03-11 23:58:36
ドラドラ(色々な事に疲れたNS)
@KAMENRIDENasuka
@koichi_kawakami @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 失礼します。 内容がさっぱりなんですが、率直に尋ねますと、日本の変異株なんですか？
2021-03-11 22:26:12
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
@KAMENRIDENasuka @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi おそらく、そうではないかと。
2021-03-11 23:14:59
Gianni.Daimajin_Jr.Return
@Gianni_Daimajin
@koichi_kawakami @twitaco @UCiS7MEgWj6L7cV お疲れ様です... いよいよ"E484K"ですね... やはり、11月頃からの保健所の 分析が必要でしたね...
2021-03-11 23:33:33
Gianni.Daimajin_Jr.Return
@Gianni_Daimajin
@koichi_kawakami @twitaco @UCiS7MEgWj6L7cV #変異株の追跡と影響 #英国型変異株ですら致死率も 上昇.. jp.reuters.com/article/health… 川上先生が丁寧に追跡されて ました.. ﾜｸﾁﾝの有効性を下げると言われて いる"E484K変異"の更なる変異の 報告です. 川上先生のﾌｫﾛｰされ,変異株培養 してるような東京,大阪では 呉々もお気を付けて下さい...
2021-03-11 23:53:42
ぴんきゅ
@ndVT0xaEfW7W0E7
Ｅ484Ｋ変異株 日本型変異なのか… 門真、ウィルス性胃腸炎めっちゃはやってたよね。そして小学校でコロナでてきてるし。大東市はコロナ対策大阪府下で最低レベルのブラックさと聞いてるし まだまだ怖い twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-12 09:07:17
sdg324
@sdg324
日本で変異した可能性が高い新種変異ウイルス。 いつ出てもおかしくないと思っていたが。 宇都宮（倉持先生のクリニック）で採取されたということだが、栃木よりはるかに人出が多い一都三県などでは相当に市中感染が進んでいると考えるのが自然。 twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-12 08:24:05
教育を考える(バイオメディカル系)
@rPSHBICmzHESsUy
6検体しか調べていないにも関わらず、そのうちの最近の1検体は変異株ということは、 第4波は変異株が主流になる可能性が高いでしょうね😢 予想はしていましたが、悲しさと悔しさがあります。 twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-12 06:50:52
原口 一博
@kharaguchi
⚠️新たな変異株 [結果]6検体を解析した。1月に採取された5検体のS遺伝子は従来型であったが、最近採取された1検体はE484K変異をもっていた。南アフリカ株はE484K以外にN501Y、K417N変異をもつことが知られているが、この検体由来のS遺伝子はN501Y、K417N変異をもっていなかった」同氏 twitter.com/koichi_kawakam… pic.twitter.com/xDMv9V1zXS
2021-03-12 03:28:15
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vogelsang7
@vogelsang7
参考になる図が。 niid.go.jp/niid/ja/diseas… news.yahoo.co.jp/pages/20210122 twitter.com/koichi_kawakam… pic.twitter.com/aUuNUIluO2
2021-03-12 00:57:07
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ramos
@ramos59454108
この結果、Spikeは、中和抗体回避と言われるE484Kしか変異入ってなさそうで少し安心した(？)。 いや、ワクチン効果落とすE484K入ってるんだけど、ウイルス量が増えるとかで知られてる変異は入ってないので。 twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-12 00:48:51
nagaya
@nagaya2013
＞日本国内で新型コロナウイルスの新たな変異株が確認され、国立感染症研究所が対応を急いでいます。 この変異株はE484Kと呼ばれるタイプの種類で、回復期の患者の中和抗体価が1/10になる特性を保持している johosokuhou.com/2021/02/19/443… ワクチン接種やり直しですか、これ？ 五輪どころじゃないですな。 twitter.com/koichi_kawakam… pic.twitter.com/ZbD51GacPD
2021-03-11 23:49:07
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バーッド・マン Ⅱ
@TBM4_JP
これがゲノム解析というやつか。。。 武漢での確認が2019年12月。英国変異株の初確認が2020年9月。免疫逃避型はもっと前から確認されてたんでしたよね。短期間で厄介な変異を獲得してしまう新型コロナの更なる変異に備えねば。検査後進国の日本は、PCR検査同様にゲノム解析体制の整備も急いで貰いたい twitter.com/koichi_kawakam… pic.twitter.com/MLcPknrvfo
2021-03-11 23:00:47
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温泉に行きたい東京都民💙💛
@crystalmint
これって以前慶應大学で発見した日本株と呼ばれるものとは違うんだろうか？慶應大学で発見した株は2件のみと言われていたけれど、また違う変化を遂げた株なのかな？ 南アフリカ株にもワクチンは一定の効果があるらしいけれど、この株に対してはどうなんだろう。気になる事が多すぎる。 twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-11 22:53:53
rgb
@C45425
ひゃっほう。 今日出た結果が今日見れるよ🤩 S遺伝子アミノ酸配列 417番目はKのまま、 484番目は在来株ではEなのにKとなる変異あり、 501番目もNのまま。 Seq1は南アフリカ変異株でも、 イギリス変異株でもないのかな..。 何変異株...？ twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-11 22:49:35
あしたろ(神蛙葦太郎🐸)
@kangaeruasitaro
ウイルスの収斂進化？みたいな？ 生存(拡大)に有利なものがあるから生き残るものに共通項として残るみたいな。 twitter.com/koichi_kawakam…
2021-03-11 22:44:08
うしろのしーちゃん
@ushironosiichan
変異株の比較表 #新型コロナ #変異株 #covid19 # pic.twitter.com/aywfwuVtjl
2021-03-12 07:12:23
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ここからは余談。予算削減にもほどがあるよ…
ナロ子
@N2primer
@koichi_kawakami @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 遺伝研が何でサンガーやってるんですか？
2021-03-11 23:35:05
Yoshio Nakatani
@yoshionakatani1
@N2primer @koichi_kawakami @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 激しく同意 日本のトップ大学・トップ研究機関にNGSが無いもしくは使えない事実の方が恐ろしい 技術的に2000年初頭で止まってます
2021-03-12 07:33:55
Yoshio Nakatani
@yoshionakatani1
@koichi_kawakami @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi 日本のトップ大学東大・トップ研究機関である遺伝研でNGS置いてないんですか？そちらの事実の方が恐ろしく、引いてしまうのですが… 全ゲノム解析されているのかとばかり思っていました。解析方法が2000年代初頭とそれ程変わらないじゃないですか、シークエンス比較もBlastのままだし
2021-03-12 07:08:24
Yoshio Nakatani
@yoshionakatani1
@koichi_kawakami @UCiS7MEgWj6L7cV @j6UrWeBPTIhDPgi ケンブリッジみたいにNGSー>オートメーションのシークエンス組み立てー>オートメーションのシークエンス比較システムが構築されているのかと思ってました これが日本の科学の現状ですか？
2021-03-12 07:26:02更に余談。
Yahoo!ニュース
@YahooNewsTopics
【アナフィラキシー 新たに12人】 yahoo.jp/p6vX9Kc 厚生労働省は11日、新型コロナウイルスのワクチンを接種した20～50代の男女12人が、重いアレルギー反応であるアナフィラキシーを発症したと発表した。いずれも投薬などで症状は回復したり快方に向かったりしている。
2021-03-12 06:51:19
こめっと
@Pokesun_moon
@YahooNewsTopics 約18万人中32人、しかもアナフィラキシーショックではなくアナフィラキシー。さらにしっかり備えてあるためすぐに回復。 多分アナフィラキシーショックとアナフィラキシーが違うって知ってる人少ないんじゃないかなこれ。
2021-03-12 08:58:12
Cook⚡規制解除（ただしいつ規制入るかわからない！）
@CookDrake
『新型コロナワクチンで17人のアナフィラキシー』、リスクの高いワクチンなのですか？/堀向健太 news.yahoo.co.jp/byline/horimuk… 📌“『アナフィラキシーを起こす可能性はあるけれども、それは必ずしもアナフィラキシーショックではない』ということ、そして現在のところ、適切な処置でみなさん回復している”
2021-03-12 11:12:45